Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD2P49005 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD2P49005 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD2P49005 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD2P49005 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD2P49005 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD2P49005 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD2P49005 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD2P49005 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD2P49005 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD2P49005 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD2P49005 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD2P49005 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD2P49005 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD2P49005 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLD2P49005 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLD2P49005 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLD2P49005 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD2P49005 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD2P49005 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD2P49005 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD2P49005 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD2P49005 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD2P49005 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD2P49005 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD2P49005 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD2P49005 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD2P49005 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD2P49005 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD2P49005 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD2P49005 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD2P49005 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD2P49005 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD2P49005 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD2P49005 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD2P49005 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD2P49005 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD2P49005 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD2P49005 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD2P49005 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD2P49005 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD2P49005 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD2P49005 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD2P49005 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD2P49005 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD2P49005 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD2P49005 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD2P49005 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD2P49005 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD2P49005 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD2P49005 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD2P49005 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD2P49005 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD2P49005 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD2P49005 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD2P49005 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms