Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GNPDA1P46926 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GNPDA1P46926 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GNPDA1P46926 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA1P46926 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA1P46926 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA1P46926 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA1P46926 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA1P46926 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA1P46926 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA1P46926 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA1P46926 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA1P46926 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA1P46926 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA1P46926 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA1P46926 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNPDA1P46926 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GNPDA1P46926 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GNPDA1P46926 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNPDA1P46926 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GNPDA1P46926 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GNPDA1P46926 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GNPDA1P46926 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNPDA1P46926 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA1P46926 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA1P46926 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA1P46926 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA1P46926 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA1P46926 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA1P46926 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA1P46926 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA1P46926 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA1P46926 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA1P46926 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA1P46926 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA1P46926 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA1P46926 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA1P46926 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA1P46926 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA1P46926 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA1P46926 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA1P46926 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA1P46926 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA1P46926 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA1P46926 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA1P46926 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA1P46926 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms