Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS9P46781 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS9P46781 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS9P46781 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS9P46781 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS9P46781 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS9P46781 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS9P46781 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS9P46781 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS9P46781 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS9P46781 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS9P46781 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS9P46781 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS9P46781 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS9P46781 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS9P46781 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS9P46781 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS9P46781 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS9P46781 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS9P46781 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS9P46781 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS9P46781 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS9P46781 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS9P46781 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS9P46781 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS9P46781 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS9P46781 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS9P46781 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS9P46781 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS9P46781 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS9P46781 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS9P46781 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS9P46781 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS9P46781 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS9P46781 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS9P46781 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS9P46781 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS9P46781 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS9P46781 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS9P46781 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS9P46781 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS9P46781 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS9P46781 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS9P46781 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS9P46781 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS9P46781 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS9P46781 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS9P46781 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS9P46781 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS9P46781 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS9P46781 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS9P46781 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS9P46781 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS9P46781 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS9P46781 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS9P46781 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS9P46781 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS9P46781 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS9P46781 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS9P46781 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS9P46781 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS9P46781 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS9P46781 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS9P46781 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS9P46781 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS9P46781 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS9P46781 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS9P46781 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS9P46781 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS9P46781 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS9P46781 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS9P46781 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS9P46781 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS9P46781 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS9P46781 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS9P46781 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS9P46781 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS9P46781 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS9P46781 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS9P46781 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS9P46781 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS9P46781 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS9P46781 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS9P46781 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS9P46781 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS9P46781 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms