Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNNT3P45378 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms