Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR1P43307 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR1P43307 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR1P43307 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR1P43307 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR1P43307 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR1P43307 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR1P43307 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR1P43307 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR1P43307 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR1P43307 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR1P43307 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR1P43307 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR1P43307 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR1P43307 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR1P43307 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SSR1P43307 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR1P43307 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR1P43307 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR1P43307 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR1P43307 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR1P43307 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR1P43307 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR1P43307 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR1P43307 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR1P43307 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR1P43307 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR1P43307 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR1P43307 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR1P43307 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR1P43307 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR1P43307 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR1P43307 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR1P43307 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR1P43307 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR1P43307 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR1P43307 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR1P43307 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR1P43307 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR1P43307 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR1P43307 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR1P43307 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR1P43307 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR1P43307 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR1P43307 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR1P43307 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR1P43307 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR1P43307 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms