Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRATP43155 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRATP43155 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRATP43155 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRATP43155 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRATP43155 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRATP43155 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRATP43155 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRATP43155 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRATP43155 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRATP43155 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRATP43155 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CRATP43155 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRATP43155 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRATP43155 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRATP43155 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRATP43155 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRATP43155 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRATP43155 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CRATP43155 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRATP43155 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRATP43155 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRATP43155 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRATP43155 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRATP43155 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRATP43155 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRATP43155 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRATP43155 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRATP43155 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRATP43155 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CRATP43155 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRATP43155 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRATP43155 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRATP43155 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRATP43155 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRATP43155 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRATP43155 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRATP43155 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRATP43155 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRATP43155 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRATP43155 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRATP43155 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRATP43155 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRATP43155 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRATP43155 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRATP43155 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRATP43155 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRATP43155 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRATP43155 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRATP43155 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRATP43155 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CRATP43155 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRATP43155 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRATP43155 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CRATP43155 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRATP43155 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRATP43155 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRATP43155 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRATP43155 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRATP43155 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRATP43155 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRATP43155 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRATP43155 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRATP43155 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRATP43155 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRATP43155 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRATP43155 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRATP43155 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRATP43155 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRATP43155 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRATP43155 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRATP43155 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRATP43155 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRATP43155 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRATP43155 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRATP43155 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRATP43155 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRATP43155 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms