Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER3P43115 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTGER3P43115 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms