Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC1A4P43007 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A4P43007 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms