Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARL1P40616 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL1P40616 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL1P40616 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL1P40616 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL1P40616 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL1P40616 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL1P40616 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL1P40616 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL1P40616 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL1P40616 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL1P40616 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL1P40616 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL1P40616 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL1P40616 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL1P40616 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL1P40616 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL1P40616 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL1P40616 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL1P40616 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL1P40616 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL1P40616 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL1P40616 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL1P40616 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL1P40616 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL1P40616 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL1P40616 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL1P40616 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL1P40616 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL1P40616 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL1P40616 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL1P40616 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL1P40616 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL1P40616 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL1P40616 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL1P40616 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL1P40616 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL1P40616 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL1P40616 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL1P40616 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL1P40616 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL1P40616 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL1P40616 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARL1P40616 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARL1P40616 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARL1P40616 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARL1P40616 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARL1P40616 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARL1P40616 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARL1P40616 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARL1P40616 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARL1P40616 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARL1P40616 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARL1P40616 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARL1P40616 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARL1P40616 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARL1P40616 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL1P40616 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL1P40616 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL1P40616 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL1P40616 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL1P40616 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL1P40616 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL1P40616 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL1P40616 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL1P40616 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL1P40616 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL1P40616 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL1P40616 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL1P40616 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms