Protein–RNA interactions for Protein: P40072

SLX8, E3 ubiquitin-protein ligase complex SLX5-SLX8 subunit SLX8, yeastyeast

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX8P40072 YIR007WYIR007W 2295 nt5.86□□□□□ -1.47
SLX8P40072 PTR3YFR029W 2037 nt5.86□□□□□ -1.47
SLX8P40072 RSC30YHR056C 2652 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 FOL1YNL256W 2475 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 ATG31YDR022C 591 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 DFM1YDR411C 1026 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 YDR491CYDR491C 492 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 RMD6YEL072W 696 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 EGD2YHR193C 525 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 YJR037WYJR037W 384 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 ASK1YKL052C 879 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 YLR171WYLR171W 390 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 YML6YML025C 861 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 YMR310CYMR310C 954 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 GRX7YBR014C 612 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 RPS9AYPL081W 594 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 GCD2YGR083C 1956 nt5.85□□□□□ -1.47
SLX8P40072 YKL075CYKL075C 1353 nt5.84□□□□□ -1.47
SLX8P40072 CWC2YDL209C 1020 nt5.84□□□□□ -1.47
SLX8P40072 DPB4YDR121W 591 nt5.84□□□□□ -1.47
SLX8P40072 PUG1YER185W 912 nt5.84□□□□□ -1.47
SLX8P40072 YIP1YGR172C 747 nt5.84□□□□□ -1.47
SLX8P40072 PHO86YJL117W 936 nt5.84□□□□□ -1.47
SLX8P40072 RPL40BYKR094C 387 nt5.84□□□□□ -1.47
SLX8P40072 IMD2YHR216W 1572 nt5.84□□□□□ -1.48
SLX8P40072 CDC50YCR094W 1176 nt5.83□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YHR125WYHR125W 306 nt5.83□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YJL193WYJL193W 1209 nt5.83□□□□□ -1.48
SLX8P40072 GEM1YAL048C 1989 nt5.83□□□□□ -1.48
SLX8P40072 SEC59YMR013C 1560 nt5.83□□□□□ -1.48
SLX8P40072 SYG1YIL047C 2709 nt5.83□□□□□ -1.48
SLX8P40072 RGD1YBR260C 2001 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 MSC7YHR039C 1935 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 ORC6YHR118C 1308 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 snR5snR5 204 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 COX9YDL067C 180 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 MET32YDR253C 576 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 MAG1YER142C 891 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 HUR1YGL168W 333 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 AML1YGR001C 747 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 CAX4YGR036C 720 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YHR130CYHR130C 336 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YAP5YIR018W 738 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 SRP40YKR092C 1221 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YLR287CYLR287C 1068 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 AAD15YOL165C 432 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 SVS1YPL163C 783 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YPR197CYPR197C 564 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 snR41snR41 95 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 CTP1YBR291C 900 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 MRK1YDL079C 1506 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 IMA1YGR287C 1770 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 THI20YOL055C 1656 nt5.82□□□□□ -1.48
SLX8P40072 HOM3YER052C 1584 nt5.81□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YML082WYML082W 1950 nt5.81□□□□□ -1.48
SLX8P40072 AIM7YDR063W 450 nt5.81□□□□□ -1.48
SLX8P40072 SLX8YER116C 825 nt5.81□□□□□ -1.48
SLX8P40072 VFA1YER128W 612 nt5.81□□□□□ -1.48
SLX8P40072 COX13YGL191W 390 nt5.81□□□□□ -1.48
SLX8P40072 GCY1YOR120W 939 nt5.81□□□□□ -1.48
SLX8P40072 RPS10AYOR293W 318 nt5.81□□□□□ -1.48
SLX8P40072 CUR1YPR158W 759 nt5.81□□□□□ -1.48
SLX8P40072 PHR1YOR386W 1698 nt5.81□□□□□ -1.48
SLX8P40072 TGL4YKR089C 2733 nt5.81□□□□□ -1.48
SLX8P40072 STB5YHR178W 2232 nt5.8□□□□□ -1.48
SLX8P40072 CDC40YDR364C 1368 nt5.8□□□□□ -1.48
SLX8P40072 ALR2YFL050C 2577 nt5.8□□□□□ -1.48
SLX8P40072 RRP3YHR065C 1506 nt5.8□□□□□ -1.48
SLX8P40072 NAM2YLR382C 2685 nt5.8□□□□□ -1.48
SLX8P40072 ATO3YDR384C 828 nt5.8□□□□□ -1.48
SLX8P40072 SDC1YDR469W 528 nt5.8□□□□□ -1.48
SLX8P40072 RPL27BYDR471W 411 nt5.8□□□□□ -1.48
SLX8P40072 VAB2YEL005C 849 nt5.8□□□□□ -1.48
SLX8P40072 MRPL9YGR220C 810 nt5.8□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YLR050CYLR050C 486 nt5.8□□□□□ -1.48
SLX8P40072 STM1YLR150W 822 nt5.8□□□□□ -1.48
SLX8P40072 SAT4YCR008W 1812 nt5.8□□□□□ -1.48
SLX8P40072 LTV1YKL143W 1392 nt5.8□□□□□ -1.48
SLX8P40072 VPS27YNR006W 1869 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 MAG2YLR427W 2013 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YER046W-AYER046W-A 330 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 SCS2YER120W 735 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 GRX4YER174C 735 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 RPN12YFR052W 825 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 MPC3YGR243W 441 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YIL024CYIL024C 570 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 DJP1YIR004W 1299 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 RPL17AYKL180W 555 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 CDC5YMR001C 2118 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 HLJ1YMR161W 675 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YGK3YOL128C 1128 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 DDP1YOR163W 567 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 TRF5YNL299W 1929 nt5.79□□□□□ -1.48
SLX8P40072 PUF3YLL013C 2640 nt5.78□□□□□ -1.48
SLX8P40072 BCP1YDR361C 852 nt5.78□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YER079WYER079W 633 nt5.78□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YER087C-AYER087C-A 552 nt5.78□□□□□ -1.48
SLX8P40072 THI5YFL058W 1023 nt5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 135.7 ms