Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IGHMBP2P38935 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGHMBP2P38935 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms