Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YGR226CYGR226C 210 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 ERV29YGR284C 933 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YLR428CYLR428C 345 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MCM1YMR043W 861 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RGS2YOR107W 930 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MCM16YPR046W 546 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MRPL27YBR282W 441 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RAD54YGL163C 2697 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 ELM1YKL048C 1923 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 DIT2YDR402C 1470 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 PRS5YOL061W 1491 nt3.4□□□□□ -1.87
AVT5P38176 HAP4YKL109W 1665 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MIG1YGL035C 1515 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RPO31YOR116C 4383 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 HEF3YNL014W 3135 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 PDS1YDR113C 1122 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YFL019CYFL019C 354 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RPB3YIL021W 957 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 CKA1YIL035C 1119 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 ATG38YLR211C 681 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 ECM15YBL001C 315 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YML047W-AYML047W-A 366 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YMR099CYMR099C 894 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 IST1YNL265C 897 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 ZDS1YMR273C 2748 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 GCR1YPL075W 2358 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 DHR2YKL078W 2208 nt3.39□□□□□ -1.87
AVT5P38176 PUB1YNL016W 1362 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 ACE2YLR131C 2313 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MIC60YKR016W 1623 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YVC1YOR087W 2028 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 FLO8YER109C 2400 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YJL220WYJL220W 453 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MBR1YKL093W 1020 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MYO3YKL129C 3819 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 SFH1YLR321C 1281 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 INP1YMR204C 1263 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YOR283WYOR283W 693 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 VPS27YNR006W 1869 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 SSH4YKL124W 1740 nt3.38□□□□□ -1.87
AVT5P38176 BUD5YCR038C 1929 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 ALA1YOR335C 2877 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RCR2YDR003W 633 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RPC11YDR045C 333 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RUB1YDR139C 234 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 ERJ5YFR041C 888 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 SCEIQ0160 708 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RSM25YIL093C 795 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 CNB1YKL190W 528 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 FMP46YKR049C 402 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YLR444CYLR444C 303 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YNL013CYNL013C 378 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YOR186WYOR186W 435 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YCL007CYCL007C 393 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 CIK1YMR198W 1785 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RNA14YMR061W 2034 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MET17YLR303W 1335 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YNL011CYNL011C 1335 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 DPH6YLR143W 2058 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MTC4YBR255W 2085 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 APE2YKL157W 2859 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 FLC1YPL221W 2382 nt3.37□□□□□ -1.87
AVT5P38176 CTF13YMR094W 1437 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MNN4YKL201C 3537 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 CHD1YER164W 4407 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 MNR2YKL064W 2910 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RPL35BYDL136W 363 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YDR203WYDR203W 318 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RDN5-1RDN5-1 121 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RDN5-6RDN5-6 121 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YML031C-AYML031C-A 336 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 SAM37YMR060C 984 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YNR062CYNR062C 984 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 LDS2YOL047C 1071 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RAS1YOR101W 930 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 SCD6YPR129W 1050 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 PRP22YER013W 3438 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YGL176CYGL176C 1665 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 RNT1YMR239C 1416 nt3.36□□□□□ -1.87
AVT5P38176 ECM16YMR128W 3804 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 ATC1YDR184C 885 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 HTB1YDR224C 396 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 COBQ0105 1158 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 LSM4YER112W 564 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YFL065CYFL065C 309 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YHI9YHR029C 885 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 YHR173CYHR173C 339 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 SVP26YHR181W 687 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 AIM22YJL046W 1230 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 PRP21YJL203W 843 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 REE1YJL217W 597 nt3.35□□□□□ -1.87
AVT5P38176 SOD1YJR104C 465 nt3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.8 ms