Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGFBR1P36897 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR1P36897 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms