Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5C1P36542 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms