Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM5P33992 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM5P33992 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM5P33992 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM5P33992 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM5P33992 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM5P33992 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM5P33992 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MCM5P33992 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM5P33992 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM5P33992 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM5P33992 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM5P33992 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM5P33992 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM5P33992 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM5P33992 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM5P33992 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM5P33992 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM5P33992 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM5P33992 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM5P33992 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM5P33992 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM5P33992 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM5P33992 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM5P33992 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM5P33992 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM5P33992 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM5P33992 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM5P33992 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM5P33992 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM5P33992 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM5P33992 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM5P33992 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM5P33992 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM5P33992 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM5P33992 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM5P33992 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM5P33992 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM5P33992 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM5P33992 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM5P33992 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM5P33992 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM5P33992 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM5P33992 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM5P33992 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM5P33992 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM5P33992 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM5P33992 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM5P33992 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM5P33992 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM5P33992 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM5P33992 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM5P33992 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM5P33992 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM5P33992 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM5P33992 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM5P33992 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM5P33992 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM5P33992 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM5P33992 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM5P33992 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCM5P33992 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCM5P33992 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM5P33992 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM5P33992 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM5P33992 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM5P33992 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM5P33992 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM5P33992 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM5P33992 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM5P33992 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM5P33992 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms