Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR1P32246 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR1P32246 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR1P32246 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR1P32246 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR1P32246 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR1P32246 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR1P32246 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR1P32246 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR1P32246 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR1P32246 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR1P32246 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR1P32246 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR1P32246 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR1P32246 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR1P32246 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR1P32246 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR1P32246 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR1P32246 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR1P32246 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR1P32246 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR1P32246 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCR1P32246 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR1P32246 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR1P32246 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR1P32246 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR1P32246 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR1P32246 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR1P32246 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR1P32246 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR1P32246 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR1P32246 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR1P32246 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR1P32246 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR1P32246 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR1P32246 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR1P32246 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR1P32246 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR1P32246 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR1P32246 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR1P32246 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR1P32246 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR1P32246 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR1P32246 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR1P32246 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR1P32246 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR1P32246 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR1P32246 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR1P32246 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR1P32246 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR1P32246 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR1P32246 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR1P32246 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR1P32246 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR1P32246 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR1P32246 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms