Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA9P31269 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA9P31269 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms