Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD1P29536 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms