Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTGFP29279 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTGFP29279 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTGFP29279 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTGFP29279 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTGFP29279 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTGFP29279 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTGFP29279 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTGFP29279 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTGFP29279 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTGFP29279 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTGFP29279 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTGFP29279 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTGFP29279 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTGFP29279 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTGFP29279 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTGFP29279 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTGFP29279 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTGFP29279 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTGFP29279 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTGFP29279 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTGFP29279 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTGFP29279 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTGFP29279 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTGFP29279 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTGFP29279 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTGFP29279 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTGFP29279 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTGFP29279 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTGFP29279 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTGFP29279 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTGFP29279 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTGFP29279 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTGFP29279 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTGFP29279 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTGFP29279 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTGFP29279 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTGFP29279 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTGFP29279 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTGFP29279 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTGFP29279 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTGFP29279 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTGFP29279 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTGFP29279 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTGFP29279 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTGFP29279 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms