Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD34P28906 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD34P28906 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD34P28906 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD34P28906 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD34P28906 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD34P28906 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD34P28906 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD34P28906 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CD34P28906 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD34P28906 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD34P28906 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD34P28906 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD34P28906 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD34P28906 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD34P28906 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD34P28906 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD34P28906 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD34P28906 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD34P28906 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD34P28906 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD34P28906 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD34P28906 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD34P28906 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD34P28906 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CD34P28906 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD34P28906 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD34P28906 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD34P28906 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD34P28906 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD34P28906 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD34P28906 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD34P28906 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD34P28906 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD34P28906 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD34P28906 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD34P28906 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD34P28906 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD34P28906 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD34P28906 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD34P28906 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD34P28906 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD34P28906 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD34P28906 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD34P28906 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD34P28906 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD34P28906 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD34P28906 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD34P28906 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms