Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP1P28562 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms