Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABRB3P28472 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABRB3P28472 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GABRB3P28472 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GABRB3P28472 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABRB3P28472 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB3P28472 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB3P28472 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB3P28472 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB3P28472 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB3P28472 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB3P28472 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB3P28472 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB3P28472 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB3P28472 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB3P28472 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB3P28472 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB3P28472 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB3P28472 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB3P28472 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB3P28472 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB3P28472 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB3P28472 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms