Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSFA2P28290 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms