Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4AP27815 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms