Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO1P25800 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO1P25800 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO1P25800 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO1P25800 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO1P25800 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO1P25800 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO1P25800 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO1P25800 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO1P25800 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO1P25800 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO1P25800 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO1P25800 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO1P25800 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO1P25800 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO1P25800 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO1P25800 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO1P25800 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO1P25800 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO1P25800 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO1P25800 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO1P25800 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO1P25800 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMO1P25800 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO1P25800 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO1P25800 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO1P25800 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMO1P25800 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO1P25800 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO1P25800 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO1P25800 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO1P25800 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO1P25800 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO1P25800 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMO1P25800 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMO1P25800 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMO1P25800 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms