Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSMA3P25788 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMA3P25788 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms