Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNE1P24864 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms