Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRGP23470 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms