Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX1P22670 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX1P22670 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX1P22670 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX1P22670 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX1P22670 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX1P22670 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX1P22670 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX1P22670 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX1P22670 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX1P22670 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX1P22670 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX1P22670 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX1P22670 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX1P22670 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX1P22670 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX1P22670 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX1P22670 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX1P22670 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX1P22670 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX1P22670 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX1P22670 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX1P22670 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX1P22670 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX1P22670 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX1P22670 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX1P22670 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX1P22670 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX1P22670 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX1P22670 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX1P22670 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX1P22670 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX1P22670 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFX1P22670 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFX1P22670 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RFX1P22670 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX1P22670 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX1P22670 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX1P22670 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX1P22670 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX1P22670 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX1P22670 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX1P22670 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX1P22670 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX1P22670 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX1P22670 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX1P22670 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX1P22670 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX1P22670 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms