Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK11BP21127 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms