Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C4BPBP20851 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms