Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFE3P19532 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFE3P19532 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFE3P19532 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TFE3P19532 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFE3P19532 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFE3P19532 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFE3P19532 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFE3P19532 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFE3P19532 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFE3P19532 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFE3P19532 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFE3P19532 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFE3P19532 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFE3P19532 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TFE3P19532 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TFE3P19532 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TFE3P19532 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFE3P19532 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFE3P19532 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFE3P19532 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFE3P19532 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFE3P19532 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFE3P19532 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFE3P19532 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFE3P19532 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFE3P19532 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFE3P19532 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFE3P19532 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFE3P19532 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFE3P19532 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFE3P19532 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFE3P19532 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFE3P19532 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFE3P19532 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFE3P19532 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFE3P19532 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFE3P19532 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFE3P19532 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFE3P19532 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFE3P19532 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFE3P19532 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFE3P19532 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TFE3P19532 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFE3P19532 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFE3P19532 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFE3P19532 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFE3P19532 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFE3P19532 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFE3P19532 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFE3P19532 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFE3P19532 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFE3P19532 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFE3P19532 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFE3P19532 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFE3P19532 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFE3P19532 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFE3P19532 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFE3P19532 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFE3P19532 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFE3P19532 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFE3P19532 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFE3P19532 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFE3P19532 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFE3P19532 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFE3P19532 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFE3P19532 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFE3P19532 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFE3P19532 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFE3P19532 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms