Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM21P19474 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms