Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms