Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI1P19237 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms