Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC2P18074 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC2P18074 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms