Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE6AP16499 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms