Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MUC1P15941 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MUC1P15941 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MUC1P15941 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MUC1P15941 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MUC1P15941 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MUC1P15941 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MUC1P15941 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MUC1P15941 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MUC1P15941 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MUC1P15941 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MUC1P15941 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MUC1P15941 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MUC1P15941 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MUC1P15941 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MUC1P15941 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MUC1P15941 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MUC1P15941 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MUC1P15941 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MUC1P15941 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MUC1P15941 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MUC1P15941 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MUC1P15941 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MUC1P15941 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MUC1P15941 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MUC1P15941 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MUC1P15941 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MUC1P15941 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MUC1P15941 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MUC1P15941 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms