Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME1P15531 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME1P15531 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME1P15531 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME1P15531 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME1P15531 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME1P15531 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME1P15531 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME1P15531 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME1P15531 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME1P15531 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME1P15531 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME1P15531 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME1P15531 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME1P15531 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME1P15531 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME1P15531 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NME1P15531 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME1P15531 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME1P15531 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME1P15531 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME1P15531 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME1P15531 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME1P15531 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME1P15531 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME1P15531 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME1P15531 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME1P15531 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME1P15531 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME1P15531 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME1P15531 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME1P15531 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME1P15531 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME1P15531 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME1P15531 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME1P15531 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME1P15531 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NME1P15531 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME1P15531 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME1P15531 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME1P15531 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME1P15531 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME1P15531 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME1P15531 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME1P15531 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME1P15531 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NME1P15531 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME1P15531 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NME1P15531 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME1P15531 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME1P15531 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME1P15531 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME1P15531 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms