Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNT1P13805 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms