Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYGBP11216 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYGBP11216 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYGBP11216 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYGBP11216 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYGBP11216 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGBP11216 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYGBP11216 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYGBP11216 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYGBP11216 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYGBP11216 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYGBP11216 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYGBP11216 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PYGBP11216 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYGBP11216 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYGBP11216 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYGBP11216 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYGBP11216 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PYGBP11216 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGBP11216 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PYGBP11216 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYGBP11216 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYGBP11216 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYGBP11216 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYGBP11216 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYGBP11216 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYGBP11216 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYGBP11216 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYGBP11216 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYGBP11216 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PYGBP11216 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PYGBP11216 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYGBP11216 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYGBP11216 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYGBP11216 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYGBP11216 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYGBP11216 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYGBP11216 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYGBP11216 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYGBP11216 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYGBP11216 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PYGBP11216 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYGBP11216 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYGBP11216 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYGBP11216 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms