Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP3P10745 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP3P10745 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP3P10745 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP3P10745 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP3P10745 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP3P10745 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP3P10745 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP3P10745 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP3P10745 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP3P10745 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP3P10745 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP3P10745 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP3P10745 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP3P10745 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP3P10745 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP3P10745 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP3P10745 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP3P10745 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP3P10745 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP3P10745 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP3P10745 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBP3P10745 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBP3P10745 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBP3P10745 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBP3P10745 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP3P10745 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP3P10745 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP3P10745 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP3P10745 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP3P10745 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP3P10745 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP3P10745 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP3P10745 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP3P10745 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP3P10745 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP3P10745 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP3P10745 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP3P10745 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP3P10745 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP3P10745 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP3P10745 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP3P10745 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms