Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GZMBP10144 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GZMBP10144 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GZMBP10144 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GZMBP10144 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GZMBP10144 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GZMBP10144 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GZMBP10144 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GZMBP10144 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GZMBP10144 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GZMBP10144 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GZMBP10144 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GZMBP10144 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GZMBP10144 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GZMBP10144 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GZMBP10144 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms