Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM225BP0DP42 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms