Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P0DMU3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P0DMU3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P0DMU3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P0DMU3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P0DMU3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P0DMU3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P0DMU3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P0DMU3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P0DMU3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P0DMU3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P0DMU3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P0DMU3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms