Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA6AP0CW24 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA6AP0CW24 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms