Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBBP0CG47 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms