Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTAP09496 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTAP09496 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTAP09496 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTAP09496 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTAP09496 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTAP09496 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTAP09496 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTAP09496 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTAP09496 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTAP09496 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTAP09496 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTAP09496 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTAP09496 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTAP09496 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTAP09496 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTAP09496 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTAP09496 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTAP09496 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTAP09496 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTAP09496 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTAP09496 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTAP09496 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTAP09496 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTAP09496 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTAP09496 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTAP09496 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTAP09496 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTAP09496 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTAP09496 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTAP09496 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTAP09496 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTAP09496 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTAP09496 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTAP09496 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTAP09496 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTAP09496 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTAP09496 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTAP09496 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTAP09496 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTAP09496 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTAP09496 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTAP09496 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTAP09496 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTAP09496 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTAP09496 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTAP09496 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms