Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFMP07197 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFMP07197 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFMP07197 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFMP07197 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFMP07197 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFMP07197 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFMP07197 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFMP07197 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFMP07197 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFMP07197 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFMP07197 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFMP07197 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFMP07197 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFMP07197 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFMP07197 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFMP07197 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFMP07197 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEFMP07197 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEFMP07197 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEFMP07197 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEFMP07197 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEFMP07197 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NEFMP07197 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEFMP07197 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEFMP07197 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFMP07197 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFMP07197 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFMP07197 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFMP07197 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFMP07197 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFMP07197 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFMP07197 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFMP07197 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFMP07197 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFMP07197 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFMP07197 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFMP07197 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NEFMP07197 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NEFMP07197 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFMP07197 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFMP07197 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFMP07197 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFMP07197 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFMP07197 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFMP07197 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFMP07197 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFMP07197 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFMP07197 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFMP07197 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFMP07197 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFMP07197 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms