Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGAVP06756 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms